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二斑素瓢虫线粒体基因组全序列测定和分析
作者: 朱国渊  段波  张永科  
单位: 云南省热带作物科学研究所  云南省热带作物科学研究所  云南省热带作物科学研究所  
关键词: 二斑素瓢虫   线粒体基因组   系统发育关系  
分类号:
摘要:

【目的】在线粒体基因组水平探讨二斑素瓢虫Illeis bistigmosa(Mulsant, 1850)完整的线粒体基因组结构特征,分析其在瓢虫科Coccinellidae内的分类地位,为揭示瓢虫科昆虫的系统发育和进化关系提供理论依据。【方法】通过 Illumina二代测序技术对二斑素瓢虫线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释,分析其结构特点和碱基组成;使用最大似然法和贝叶斯法构建瓢虫科16个种线粒体基因组的系统发育树,分析其在瓢虫科内的系统发育关系。【结果】二斑素瓢虫线粒体基因组序列全长17 840 bp,包含13个蛋白质编码基因,22个转运RNA基因,2个核糖体RNA基因和1个A+T富含区(A+T rich region)。全序列的A+T的平均含量为78.44%,表现明显的A+T偏斜。37个基因中除cox1基因是以TTG为起始密码子,其余蛋白质编码基因均以ATN起始;nad4、nad5、cox2、cox3基因以不完整终止密码子T结尾。除trnS1、trnP基因,其余20个tRNAs的二级结构均为典型的三叶草结构,二级结构中有U-U或U-G碱基错配现象。系统发育分析显示,瓢虫亚科的所有物种聚在同一分支,支持该亚科的单系性;二斑素瓢虫与素菌瓢虫属Illeis另外2个种(柯氏素菌瓢虫Illeis koebelei、素鞘瓢虫Illeis cincta)聚为一个分支,组成姐妹关系。【结论】获得了二斑素瓢虫的线粒体基因组全序列,二斑素瓢虫线粒体基因组符合瓢虫科线粒体基因组的一般特征,研究结果有助于加深对瓢虫亚科线粒体基因组学和系统发育关系的理解。

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