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森林草莓糖基转移酶基因家族的生物信息学及基因表达分析
作者: 赵倩倩  周厚成  
单位: 中国农业科学院郑州果树研究所  中国农业科学院郑州果树研究所  
关键词: 关键词:森林草莓  UGT基因家族  基因结构  基因功能  表达分析  
分类号:
摘要:

摘要:【目的】通过对森林草莓UGT基因家族开展生物信息学分析及基因表达分析,了解森林草莓UGT家族基因的结构和功能。【方法】基于Phytozome数据库,从中鉴定了138个UGT基因,运用生物信息学方法分析这些UGT基因的蛋白理化性质、基因结构、保守结构域和进化关系。运用qRT-PCR方法测定基因的相对表达量。【结果】FvUGT基因家族可分为12个类群(A、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L和N),每个类群分别包含16、2、23、32、32、8、15、5、57、3、21和4个成员;染色体定位发现其家族成员的编码基因除第2条染色体之外其他染色体上都有分布,且分布不均;FvUGT内含子长度、外显子位置和数目在不同成员之间都存在差异,FvUGT家族在进化的过程中产生了较强的分化。通过qRT-PCR研究了7个UFGT基因在森林草莓不同组织和果实不同发育时期的表达特性,FvUFGT94基因在根、叶和果实各个组织中表达量皆高,而FvUFGT70在叶和叶柄中的表达量较高,FvUFGT67和FvUFGT68在根中的表达量显著高于叶柄、叶和果实;FvUFGT33在果实中的表达量显著高于根、叶柄和叶,FvUFGT95和FvUFGT96表达模式相似,在果实中的表达量显著高于其他组织。在森林草莓果实成熟期,FvUFGT33和FvUFGT95这2个基因在森林草莓红果类型表达量显著高于森林白果类型。【结论】FvUFGT基因在不同森林草莓类型根、叶、果中均表达,其中FvUFGT33在果实中的表达量最高,并且在森林红果类型中的表达量显著高于森林白果类型,与红色表型相关,该基因可能参与花色苷的合成。

基金项目:
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