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SNP标记与罗氏沼虾生长性状的相关性分析
作者: 周晓敏  戴习林  孔嘉明  
单位: 上海海洋大学  
关键词: 罗氏沼虾  生长性状  SNP标记  相关性分析  
分类号:
摘要:

【目的】为探讨SNP标记与罗氏沼虾生长性状之间的关联性,为罗氏沼虾的分子标记辅助育种提供助力与参考。【方法】采用直接测序技术对25个SNP标记在罗氏沼虾生长性状极端群体中进行多态性检测。【结果】除SNP13位点外均表现出了多态性,采用χ2检验筛选出5个标记在极端群体中与罗氏沼虾生长状况存在潜在相关性。进一步在浙江群体中验证此5个SNP标记与生长性状之间的关联性,运用一般线性模型对SNP标记与罗氏沼虾体长、头胸甲宽、第一腹节宽、第一腹节高和体重五个生长性状的关联性进行检测。结果显示,有4个位点与生长性状呈显著相关(P<0. 05),其中位点SNP6与体长、头胸甲宽和体重显著相关(P<0. 05);SNP7和SNP16与五个生长性状均呈显著相关(P<0. 05);SNP24仅与第一腹节高中存在显著相关。推断SNP6位点的GG基因型、SNP7位点的AA基因型与SNP24 CG基因型可能是这些位点的优势基因型,SNP16位点的GG基因型可能是该位点的劣势基因型。对浙江60个个体体长50%小个体和体长50%大个体两个群体中4个位点的基因型频率进行统计(表6),结果显示,SNP6和SNP24 2个标记与生长关联性显著,SNP7和SNP16与生长的关联性极显著,结果与极端群体中的基因型频率分析结果一致。【结论】对与生长性状显著相关的4个位点不同基因型所对应的生长性状分布进行统计作小提琴图,其中位线所在位置与多重比较得出的结果相一致,再次验证了各位点基因型的生长关联性。

基金项目:
参考文献:
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