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基于SSR标记的广西荔枝遗传多样性分析及核心种质构建
作者: 李冬波  李鸿莉  
单位:
关键词: 荔枝 SSR标记 遗传多样性 核心种质  
分类号:
摘要:

摘要: 【目的】利用SSR标记对广西荔枝种质资源进行遗传多样性分析和构建核心种质, 为广西荔枝种质资源的保存、遗传改良及创新利用提供理论依据。【方法】用SSR标记对88份荔枝种质资源进行遗传多样性和聚类分析,在此基础上构建广西荔枝核心种质。【结果】40对SSR引物在88份荔枝种质资源中共扩增出282个条带,不同引物的扩增条带在2-13条之间,平均7.28 条,其中有182条为多态性带,多态率达64.54%。系统聚类分析结果表明,88份荔枝种质资源的相似系数在0.83-0.96之间,说明其遗传多样性较低。在相似系数0.86处,可将其分为7大类群。88份荔枝种质资源在40个SSR位点的平均观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon信息指数(I)和Nei期望杂合度(Nei)分别为3.2750、2.1137、0.8092和0.5107。采用逐步聚类优先取样法按原始群体50.00%、25.00%和12.50%的取样比例构建了3个核心种质,最终确定的广西荔枝核心种质共包含22份种质资源。通过t 检测,最终核心种质的遗传参数与原始种质无显著差异。【结论】SSR标记是一种适用于荔枝资源遗传多样性分析和核心种质构建的理想分子标记,采用逐步聚类优先取样法构建含22份资源的核心种质能够代表原始种质资源的遗传多样性。

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