<<登录旧系统审稿   登录新系统审稿>>

建议您登录自己的邮箱点击审稿链接进入审稿系统 ×
首页 学报新闻 学报概况 编委会 专家库 学术影响 投稿指南 审核流程 标准规范 下载专区 投诉邮箱 联系我们 EngLish

正文 您当前的位置:首页》正文

大豆脱落酸受体GmPYLs基因家族鉴定、系统进化及表达分析
作者: 张兆涵  解莉楠  张天旭  王万鹏  
单位: 东北林业大学  东北林业大学  东北林业大学  东北林业大学  
关键词: GmPYLs  基因家族  非生物胁迫  ABA信号途径  差异表达  
分类号:
摘要:

【目的】利用生物信息学方法鉴定大豆脱落酸受体GmPYLs基因家族成员,分析其生物学信息、进化模式及表达模式,为深入研究该基因家族在大豆生长发育和应对非生物胁迫中的作用提供理论参考。【方法】将已报道的拟南芥AtPYLs基因家族成员作为参考,利用JGI、NCBI数据库鉴定出大豆GmPYLs基因家族成员。利用生物信息学方法,对该基因家族组成、基因结构、保守性、进化关系、启动子区顺式作用元件及其编码蛋白结构域等进行分析,并基于高通量转录组测序数据,对大豆GmPYLs基因家族成员的表达模式进行分析。【结果】本研究利用多种生物信息学的方法鉴定出21个大豆GmPYLs基因,基因序列长度500~4000 bp,分布于15条染色体上,编码的蛋白分子量19.5~29.1 KD,其编码蛋白质氨基酸数量178~267个,分子量19457.11~29105.43Da,等电点(PI)4.82~7.23,是主要分布于胞质中的亲水蛋白。蛋白的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。GmPYLs基因家族可分为四个组别,在同一组别中,基因结构、氨基酸序列、蛋白三级结构、功能域和保守基序非常相似。大豆中的旁系同源基因对数量多于拟南芥。顺式作用元件分析显示,21个大豆GmPYLs基因的启动子区分别至少含有一个激素响应元件,以脱落酸响应元件居多。转录组测序分析结果显示,GmPYLs基因在单一品种的各个组织部位和不同品种的不同组织部位均存在表达模式差异。【结论】大豆GmPYLs基因家族成员进化上保守。在豆科植物分化后发生了复杂的基因组复制事件,且大部分GmPYLs基因被保留。在应答非生物胁迫方面存在广泛的潜在机制,尤其与激素响应密切相关。表达模式具有组织特异性和品种间差异性。

基金项目:
参考文献:
总浏览数: 9 3 5 3 6 0 5  今日总人数: 1 0 6 9 3 4
主办:广西农业科学院    地址:广西南宁市大学东路174号   邮政编码:530007
电话:(+86)-771-3243905; (+86)-771-3244920   电子邮箱:nfnyxb@163.com
Copyright © 2011 Nfnyxb.com, All Rights Reserved  版权所有©2011《南方农业学报》编辑部   
 本系统由北京博思汇文数字科技有限公司设计开发 技术服务电话:400-921-9838

;