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三株猪博卡病毒的全基因遗传进化及重组分析
作者: 覃绍敏  吴健敏  
单位: 广西壮族自治区兽医研究所  广西壮族自治区兽医研究所  
关键词: 猪博卡病毒  遗传  重组  
分类号:
摘要:

【目的】掌握广西猪博卡病毒(Porcine bocavirus, PBoV)的感染情况及遗传学特征,为有效防控广西PBoV提供科学依据。【方法】采用PCR方法对采集自广西境内的388份猪源样品进行检测,挑选阳性样品进行全基因扩增,并克隆、测序和对比分析;分别使用MEGA5.2和Simplot 3.5.1软件对全基因序列进行遗传进化和基因重组分析。【结果】内脏组织、扁桃体、脑组织和公猪精液的检出率分别为25.2%(34/135)、8.3%(2/24)、2.9%(1/34)和1.5%(3/195)。在所有的检测样品中,G3基因群的阳性率为9.0%(35/388),G2和G1的阳性率均为1.5%(6/388)。从PBoV阳性样品中扩增获得3条PBoV全基因序列,命名为GXBH2014、GXBH2015 和GXLC2014,全长分别为5055bp、5070bp和4313bp。遗传进化分析显示,GXBH2014株和GXBH2015株属于PBoVG3进化分支,GXLC2014株属于PBoVG1进化分支。通过基因重组软件分析,发现在GXBH2014株的NP1基因检测到一个潜在的重组断点。【结论】广西猪群中普遍存在PBoV感染,且不同基因群毒株同时存在。GXBH2014株可能是基因重组的产物。

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