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七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)雌、雄脑组织转录组mRNA差异表达分析
作者: 刘怡南  陈再忠  
单位: 上海海洋大学水产与生命学院  上海海洋大学水产与生命学院  
关键词: 转录组  七彩神仙鱼    性别差异  
分类号:
摘要:

【目的】对七彩神仙鱼雌雄鱼大脑进行转录组学分析,挖掘性别差异基因,为大脑性别相关基因调控繁殖生理研究奠定基础。【方法】利用Illumina Hiseq 6000研究平台对雌雄脑组织样本进行转录组测序,通过过滤、Trinity组装获得到Unigene,使用DIAMOND软件对比数据库获得相应的功能注释,通过生物信息学方法筛选差异候选基因,随机挑选了6个基因进行荧光定量PCR验证。【结果】构建了6个cDNA文库,质量筛选后,获得了34109个基因和67488转录本,对比nr、GO、KEGG、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG数据库获得基因相关功能,利用统计学方法筛选获得了85个差异表达基因,与雌性相比,61个差异基因在雄性脑中上调,24个下调,包括黑色素浓集激素(MCH)、催乳素释放激素(Prlh)、垂体同型框转录因子2(PITX2)、免疫球蛋白家族成员(DSCAM、IGDCC3)、溶质载体(UNC93B1)、醛糖还原酶( AKR1B1),这些基因调节大脑促性腺激素释放激素、促黄体素、催乳素、催卵泡激素的形成以及配子的发生过程。【结论】通过转录组测序获得了雌雄脑组织差异表达的基因,可为七彩神仙鱼大脑性别差异研究、大脑调控生殖系统方面提供重要的基础资料。

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