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木薯MeETR1基因克隆及表达分析
作者: 陈志晟  赵思涵  田丽波  商桑  胡伟  颜彦  
单位:
关键词: 木薯  乙烯受体  采后生理性变质  基因克隆  表达分析  
分类号:
摘要:

【目的】本研究克隆一个木薯乙烯受体基因命名为MeETR1,对其进行生物信息学分析,并利用QPCR检测MeETR1基因在木薯采后生理性变质过程的表达情况,为研究ETR基因家族在木薯采后生理性变质过程的功能提供理论参考。【方法】以木薯品种SC8为材料,应用PCR技术扩增MeETR1基因的cDNA序列,使用生物信息学方法对其编码的氨基酸序列进行理化性质、亲疏水性、保守结构域、同源氨基酸序列比较以及二、三级结构的预测分析,并进行亚细胞定位确定基因在植物细胞中的表达位置,利用荧光定量PCR检测MeETR1基因在木薯采后生理性变质过程的表达水平。【结果】本研究克隆获得MeETR1基因CDS序列全长为2220 bp,共编码739个氨基酸;MeETR1编码蛋白属于疏水蛋白,含有乙烯受体ETR1家族4个典型的模块,即GAF结构域、HisKA结构域、HATPase_c结构域以及REC结构域,证实是该家族成员。经过同源氨基酸序列比对和进化树构建发现木薯MeETR1与同是大戟科的蓖麻(Ricinus communis)ETR蛋白亲缘关系最近;亚细胞定位结果显示MeETR1编码蛋白定位在细胞质中。通过QPCR分析MeETR1基因在木薯块根采后0 h、12 h、24 h、48 h、96 h的表达谱,发现MeETR1基因表达量呈现明显的下降趋势。【结论】上述结果表明MeETR1基因响应木薯采后生理性变质过程,可能在木薯采后生理性变质过程中具有重要作用。

基金项目:
参考文献:
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