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鸡CMTR2基因的分子特征和表达分析
作者: 李修岭  徐香慧  邢晋祎  
单位: 临沂大学  临沂大学  
关键词: 肉鸡  CMTR2基因  生物信息学  表达水平  
分类号:
摘要:

【目的】克隆鸡CMTR2基因序列,并对其进行生物信息学分析,为进一步研究CMTR2基因的结构和功能提供依据。【方法】以肉鸡为试验材料,利用RT-PCR方法克隆CMTR2基因,利用定量PCR(qRT-PCR)技术分析其表达特征。【结果】成功克隆了肉鸡CMTR2基因序列长度为2350 bp(登录号:MN296490),CDS区的长度为2292bp,编码763个氨基酸,分子质量为86855.48ku,等电点为6.08。肉鸡CMTR2氨基酸序列与火鸡同源性最高(95.94%),与斑马鱼的同源性最低(44.21%);进化树分析也表明肉鸡CMTR2氨基酸序列与火鸡的亲缘关系较近。CMTR2蛋白为不稳定亲水性蛋白,没有信号肽和跨膜域,含有61个磷酸化位点、15个二硫键、1个N-糖基化位点和8个O-糖基化位点;二级结构主要由α螺旋和无规卷曲组成,没有完整的三级结构。【结论】CMTR2基因在不同物种中具有较高的保守性,该基因在脾脏表达最高,在心脏表达最低,在不同日龄肝脏中表达存在差异。

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