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三穗鸭ATF4基因SNP鉴定及其与蛋壳品质的关联分析
作者: 谭光辉  李杰章  覃媛钰  吴磊  张依裕  
单位: 贵州省贵阳市花溪区贵州大学动物科学学院崇德楼328  贵州省贵阳市花溪区贵州大学动物科学学院崇德楼328  
关键词: 三穗鸭  ATF4基因  SNP位点  多态性  蛋壳品质  
分类号:
摘要:

转录激活子4 (activating transcription factor 4,ATF4)是活化转录因子家族中的一员,在细胞通路调控、钙离子通路调控中有重要作用。【目的】旨在探讨鸭ATF4基因单核苷酸多态性(SNPs)与其蛋壳品质的关联,为提高蛋壳品质寻找新的遗传分子标记。【方法】试验以三穗鸭为研究素材,采用PCR产物纯化后直接测序技术,DNAStar软件MegAlign程序结合测序峰图筛查鉴定鸭ATF4基因全部编码区变异位点,一般线性模型(GLM)分析SNPs对蛋壳品质的遗传效应。【结果】SNPs鉴定结果表明,在ATF4基因第3外显子发现3个(g.2394 G>A、g.2571 A>G、g.2667 A>G)同义突变位点,3个SNPs位点均为中度多态且都符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),联合产生4种单倍型和9种双倍型,关联分析结果显示,g.2571 (A>G)位点对三穗鸭蛋重和蛋壳重的影响达到显著水平(P<0.05),其他各位点对蛋壳品质指标的影响未能达到显著差异(P>0.05);3个SNPs位点联合对蛋重、蛋形指数、蛋壳重、蛋壳强度和蛋壳厚度有显著性影响(P<0.05)。【结论】揭示在ATF4基因外显子3发现的3个SNP位点相互联合能显著蛋壳品质,可能作为鸭蛋壳品质选择的遗传标记。

基金项目:
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