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滇陆猪Nramp1基因多态性对其在组织中表达的影响
作者: 张斌  赵智勇  赵彦光  
单位: 云南省畜牧兽医科学院  云南省畜牧兽医科学院  云南省畜牧兽医科学院  
关键词: 滇陆猪  自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(Nramp1)基因  多态性位点  PCR  荧光定量PCR  
分类号:
摘要:

摘要:【目的】明确自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(Nramp1)基因多态性位点变异对其在滇陆猪群体各组织中表达的影响。【方法】采用PCR对27头滇陆猪目的基因进行扩增,通过测序检测其多态性位点(SNPs),同时利用qPCR对目的基因在滇陆猪各组织中的相对表达量进行检测,并运用SPSS软件分析滇陆猪目的基因多态性与其在各组织中相对表达量的相关性。【结果】在滇陆猪目的基因外显子5、内含子5和外显子6上分别发现SNP1(T→C)、SNP2(A→G)和SNP3(G→A)等3个多态性位点,均仅有两种基因型,并且SNP1位点和SNP3位点在实验群体中处于低度多态(PIC/He<0.25),SNP2位点处于中度多态(0.25<PIC/He<0.5)。组织差异性表达结果显示,目的基因在滇陆猪各组织之间的表达量均存在显著性差异(P<0.05),并呈现肺>肝脏>脾脏>心脏;另外目的基因在滇陆猪不同基因型群体中表现的组织差异性表达不同,以及在SNP2位点的变异导致其在纯合群体和杂合群体肝脏中的表达量产生显著差异(P<0.05)。【结论】Nramp1基因多态性位点的变异能够影响其在滇陆猪各组织中表达量的变化,从而影响滇陆猪机体的免疫应答反应,并且SNP2位点可作为滇陆猪抗病育种的分子标记。

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