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基于SCoT分子标记的48份杨桃种质遗传多样性分析
作者: 欧景莉  朱杨帆  陈豪军*  周俊岸  陈 燕  何 江  宁 琳  潘祖建  甘卫堂   
单位: (广西农业科学院广西亚热带作物研究所  南宁 530001)  
关键词: 杨桃   遗传多样性   SCoT标记   聚类分析   主成分分析  
分类号:
出版年,卷(期):页码:2019 ,50 ( 8 ): 页码:1680-1687
摘要:

【目的】分析48份杨桃种质的遗传多样性,为杨桃种质资源的鉴定保护及开发利用提供理论依据。【方法】从60条SCoT引物中筛选出扩增条带清晰稳定、多态性丰富的引物,对从国内外收集的48份杨桃种质材料进行PCR扩增,统计分析电泳图谱,利用Popgene 1.32计算其遗传多样性参数,采用NTSYSpc 2.1计算种质间的遗传相似系数和遗传距离,利用UPGMA法进行聚类分析,并根据遗传相似系数进行主成分分析。【结果】从60条SCoT引物中筛选出的11条引物共扩增出115条条带,其中多态性条带102条,占总条带数的88.7%,每条SCoT引物扩增的总条带数(TNB)和多态性条带数(NPB)分别为10.45和9.27条,多态性比率(PPB)为70.00%~100.00%,平均为88.84%;多态性信息量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)的平均值分别为0.77、1.7758、0.4229和0.6061。48份杨桃种质间的遗传相似系数为0.4957~0.9217,平均为0.6841。聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.6618处可将48份杨桃种质划分为三大类群,第Ⅰ类群均为甜杨桃种质,第Ⅱ类群以酸杨桃种质为主,第Ⅲ类群以甜杨桃种质为主。主成分分析结果与聚类分析结果基本一致,均与杨桃的果实风味和种质来源高度相关。【结论】杨桃种质资源具有较丰富的遗传多样性,且筛选获得的SCoT引物对杨桃种质资源有较高的多态性检测率,适用于杨桃种质资源鉴别及亲缘关系分析。

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