【目的】探究不同杂交策略下马氏珠母贝二元杂交子代的生长性状和养殖存活情况，为广西马氏珠母贝群体杂交育种配套系构建及选择育种提供参考依据。【方法】以马氏珠母贝海选1号（H）自育F4代群体和北海野生群体（Y）自繁F1代群体为亲本，通过二元杂交构建36个正反杂交家系，并以H亲本和Y亲本的自繁群体F1代分别构建对照群组（PH和PY）；各群组经海区养殖14个月后采集壳长（SL）、壳高（SH）、壳宽（SW）和体质量（BW）等数据，利用混合线性模型（动物模型）进行生长性状遗传参数估计。【结果】在H（♂）×Y（♀）杂交子代中，SL、SH、SW和BW的遗传力（h2）分别为0.241、0.149、0.220和0.062，遗传相关系数（γg）范围为0.894~0.964，表型相关系数（γp）范围为0.558~0.865；在Y（♂）×H（♀）杂交子代中，SL、SH、SW和BW的h2分别为0.110、0.156、0.121和0.067，γg范围为0.981~0.989，γp范围0.603~0.881；2个杂交子代的生长性状表现为中低遗传力，且遗传相关高于表型相关。Y（♀）和Y（♂）群体的一般配合力（GCA）较高，说明更适合用于杂交配套；H（♂）×Y（♀）杂交子代中SL、SH和SW的特殊配合力（SCA）相对较高，且均为中低遗传力。在2个杂交子代中，4个生长性状的杂种优势分别为-0.02%~2.82%和-0.03%~0.27%，均以SL的杂种优势最高、SW的杂种优势最低。在H（♂）×Y（♀）杂交子代中SL、SH和BW等3个生长性状的杂种优势家系率为50.00%~72.22%，优势家系选择率≥50.00%；养殖存活性状的超亲优势家系率为19.44%，杂种优势家系率为61.11%，2个杂交子代和PY群体均表现出优势存活性状。【结论】H（♂）×Y（♀）杂交子代具有生长性状优势，Y（♂）×H（♀）杂交子代具有存活性状优势，2个杂交子代均存在综合杂种优势，可进行一般杂交育种应用；北海野生群体亲本的GCA较高，其SL和SH的遗传力及与BW的遗传相关也相对较高，在进行广西马氏珠母贝群体杂交制种时可考虑以野生群体子代作为专门化亲本来源，且对2龄亲本性状选择上宜优先考虑SL和SH。