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【目的】采用ISSR分子标记对13份广西收集引进和选育的香蕉种质资源进行遗传多样性分析，为广西香蕉品种改良及枯萎病抗性育种提供参考依据。【方法】从100条ISSR引物中筛选出多态性引物进行PCR扩增，利用PoPgen 1.32计算遗传多样性指数，DICE法计算遗传相似系数。利用非加权平均距离法（UPGMA）进行聚类分析。【结果】共筛选出8条扩增产物条带清晰、多态性好的ISSR引物，利用其从13份香蕉种质材料中扩增出234条条带，平均每条引物扩增出29.25条条带，其中多态性条带229条，多态性比率97.86%，平均观察等位基因数（Na）1.9786、有效等位基因数（Ne）1.4023、Shannon多样性信息指数（I）0.2603、Nei’s基因多样性指数（H′）0.4135。13份香蕉种质材料的遗传相似系数为0.50~0.90，其中，巴贝多与GK1的遗传相似系数最小，为0.50，抗枯1号与抗枯5号的遗传相似系数最大，为0.90。在遗传相似系数0.59处可将13份香蕉种质资源聚成四大组，其中第Ⅱ组在相似系数0.74处被分为a和b亚组。在遗传相似系数0.90处可将13份香蕉种质材料完全区分开。【结论】广西香蕉种质资源的遗传多样性非常丰富。利用ISSR分子标记可将遗传背景及形态特征不同的香蕉种质资源进行有效分类，可用于香蕉种质资源分类、亲缘关系鉴定及辅助育种等研究。
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