【目的】探讨有机肥替代化肥对设施土壤环境、番茄品质及产量的影响，为设施番茄科学有效的有机肥替代无机肥提供理论依据。【方法】以番茄青农866为试验材料，设置有机肥不同配施量处理（CK，100%化肥；T1，15%有机肥+85%化肥；T2，30%有机肥+70%化肥；T3，45%有机肥+55%化肥；T4，60%有机肥+40%化肥；T5，75%有机肥+25%化肥；T6，100%有机肥）。研究不同处理对土壤微生物数量、土壤酶活性、土壤团粒结构、土壤养分及番茄品质和产量的影响。【结果】有机肥替代化肥能提高设施土壤微生物数量和酶活性，其中T3处理真菌数量最多，为50.0×105 CFU/g，土壤细菌数量以T4处理最多，为6.3×108 CFU/g；土壤过氧化氢酶活性和脲酶活性均以T5处理为最高，分别为0.44和16.38 mg/g，T4处理的土壤蔗糖酶活性最高，为0.35 mg/g。与CK相比，>0.25 mm水稳性团聚体含量增加12.94%~20.59%，土壤有机质含量增加26.30%~143.37%，全氮含量提高16.56%~129.80%，C/N提高6.29%~17.39%。此外，有机肥替代化肥能改善番茄品质和提高产量，T1处理的番茄红素含量最高，达7.22 mg/kg，较CK增加80.50%，糖酸比以T2和T1处理较佳，分别为8.80和8.67；产量以T1处理最高，为161890.94 kg/ha，较CK增产12.01%。【结论】有机肥替代化肥能显著改善设施土壤环境、提高番茄品质及产量的影响，且土壤环境改善与品质、产量的提高并非不可协调，在实际番茄生产中可优先采用减少15%化肥施用量同时配施适当有机肥的处理。