【目的】了解5种常见甘蔗病毒性病害在云南的发生情况，明确其病原病毒的种类和分布，为制定云南地区甘蔗病毒性病害的防治策略提供理论依据。【方法】利用PCR和RT-PCR对采集自云南保山、临沧和德宏3个甘蔗种植区的113份样品进行甘蔗花叶病毒（Sugarcane mosaic virus， SCMV）、高粱花叶病毒（Sorghum mosaic virus， SrMV）、甘蔗线条花叶病毒（Sugarcane streak mosaic virus， SCSMV）、甘蔗黄叶病毒（Sugarcane yellow leaf virus， SCYLV）和甘蔗杆状病毒（Sugarcane bacilliform virus， SCBV）的分子鉴定。【结果】113份甘蔗样品中有89份检出病毒，病毒检出率为78.8%，检出的病毒种类有SrMV、SCSMV、SCYLV和SCBV，检出率分别为5.3%、11.5%、20.4%和70.8%，未检出SCMV。30份样品存在病毒复合侵染现象，复合侵染率为26.5%，其中有27份样品为2种病毒复合侵染，占23.9%，3份样品发生3种病毒复合侵染，占2.7%；未发现4种或5种病毒复合侵染的现象。【结论】目前云南地区甘蔗病毒性病害由SrMV、SCSMV、SCYLV和SCBV引起，其中SCBV广泛分布，SrMV、SCSMV和SCYLV具有一定程度的分布；病毒复合侵染现象明显，以2种病毒复合侵染为主。