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_________________东方泽泻实时荧光定量PCR内参基因的筛选及AoSS基因的组织表达特性分析
作者: 刘青芝1  谷巍1*  孙云飞2*  吴启南1  巢建国1  桑晓华1  王小浩1  刘琪1   
单位: (1南京中医药大学药学院  南京210023;2 江苏省中医院  南京210029)  
关键词: :东方泽泻  内参基因  鲨烯合酶(SS)  实时荧光定量PCR(qRT-PCR)  表达特性  
分类号:S567.239
出版年,卷(期):页码:2018 ,49 ( 8 ): 页码:1467-1475
摘要:

摘要:【目的】筛选适用于东方泽泻实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的内参基因,并分析其鲨烯合酶基因(AoSS)的

表达特性,为后续研究东方泽泻原萜烷型三萜生物合成调控及诱导机制打下基础。【方法】从东方泽泻转录组中选取

内参基因18S rRNA、EF1α、GAPDH、ACT、UBQ和UBC,应用qRT-PCR检测其在不同组织和激素处理下的表达情况,

并借助Delta CT、GeNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其表达稳定性进行分析评价。以筛选到的内参基因

分析AoSS基因在不同组织中的表达情况。【结果】18S rRNA、GAPDH和EF1α基因在东方泽泻不同组织的表达稳定性

较高,但18S rRNA、UBC和EF1α基因在不同激素处理下的表达稳定性均较高。以18S rRNA、GAPDH和EF1α基因为

内参分析AoSS基因在东方泽泻不同组织中的表达量情况,结果显示,AoSS基因在东方泽泻不同组织中均有表达,其

表达情况基本一致,均在东方泽泻块茎中表达量最高,其次是叶柄和叶,而在根中表达量最低。【结论】18S rRNA、

GAPDH和EF1α基因是研究东方泽泻不同组织中基因表达分析的首选内参基因;18S rRNA、EF1α和UBC基因是研究

激素处理下基因表达的首选内参基因。AoSS基因的表达具有组织特异性,其可能在东方泽泻的生长发育中发挥重

要的调控功能。


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